通车初期为确保冬季运营安全，实行冬季和夏季两张列车运行图，分别按时速200公里和300公里开行动车组列车。每年12月1日至次年4月21日实行冬季运行图，运行时速200公里;4月21日至12月1日实行夏季运行图，运营时速300公里。2013年9月开通的盘营高铁也比照办理。
经过近3年的运营实践，铁路部门探索研究出了一整套克服季节性冻土影响、控制高铁冬季冻胀的办法，积累了有效应对恶劣天气的安全运营经验。经研究论证，铁路部门认为目前哈大、盘营高铁已具备了全年按时速300公里安全运营的条件。哈大、盘营高铁优化运行方案后，铁路部门将继续加强监测，落实成熟的预防整治措施，完善高寒地区高速铁路的运营管理。同时，在保证安全的情况下，将提高运营品质，缩短旅行时间，方便旅客出行。